Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HP1BP3Q5SSJ5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HP1BP3Q5SSJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms