Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
FFAR4Q5NUL3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FFAR4Q5NUL3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms