Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP29Q52LW3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms