Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC38Q502W7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC38Q502W7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms