Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP21-3Q3LHN1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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