Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VWC2Q2TAL6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms