Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HMGN3Q15651 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HMGN3Q15651 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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