Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TAF11Q15544 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms