Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNN3Q15417 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CNN3Q15417 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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CNN3Q15417 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CNN3Q15417 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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CNN3Q15417 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNN3Q15417 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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