Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 220.69■□□□□ 0.92e-10■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-10■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 HOXB7-203ENST00000567101 528 ntTSL 211.31□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 22.9
PCBP1Q15365 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.777e-10■■■■□ 22.8
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PCBP1Q15365 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 22.8
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PCBP1Q15365 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.193e-7■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.043e-7■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-11■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 MINK1-204ENST00000571207 4569 ntTSL 514.64□□□□□ -0.073e-7■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 RTKN-210ENST00000492013 853 ntTSL 213.59□□□□□ -0.232e-9■■■■□ 22.8
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PCBP1Q15365 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 22.8
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PCBP1Q15365 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 22.8
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PCBP1Q15365 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 22.8
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PCBP1Q15365 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.092e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.172e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 11e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 SEPT9-245ENST00000592481 1291 ntTSL 522.89■■□□□ 1.253e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 SEPT9-221ENST00000588958 879 ntTSL 218.08■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 213.02□□□□□ -0.333e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 SEPT9-247ENST00000593189 817 ntTSL 512.6□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 18e-7■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.928e-7■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.392e-8■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.262e-8■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 220.5■□□□□ 0.872e-8■■■■□ 22.8
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PCBP1Q15365 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.552e-13■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-8■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 NDUFS7-208ENST00000538662 1186 ntTSL 216.85■□□□□ 0.292e-13■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 NDUFS7-209ENST00000538929 630 ntTSL 416.46■□□□□ 0.232e-13■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-213ENST00000555458 705 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-8■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-8■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.042e-13■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 NDUFS7-204ENST00000436115 2879 ntTSL 514.84□□□□□ -0.032e-13■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-219ENST00000610370 3187 ntTSL 213.49□□□□□ -0.252e-8■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 SYNGAP1-204ENST00000449372 3930 ntTSL 513.48□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 SYNGAP1-207ENST00000628646 4264 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-8■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.582e-8■■■■□ 22.8
PCBP1Q15365 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.734e-12■■■■□ 22.7
PCBP1Q15365 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.444e-12■■■■□ 22.7
PCBP1Q15365 PIK3R2-202ENST00000426902 3273 ntTSL 216.99■□□□□ 0.314e-12■■■■□ 22.7
PCBP1Q15365 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.136e-9■■■■□ 22.7
PCBP1Q15365 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.062e-7■■■■□ 22.6
PCBP1Q15365 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-7■■■■□ 22.6
PCBP1Q15365 RAD23A-210ENST00000593114 1691 ntTSL 518.18■□□□□ 0.52e-7■■■■□ 22.6
PCBP1Q15365 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 22.6
PCBP1Q15365 FCGRT-203ENST00000452439 1351 ntTSL 219.7■□□□□ 0.742e-7■■■■□ 22.6
PCBP1Q15365 FCGRT-212ENST00000598319 1888 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-7■■■■□ 22.6
PCBP1Q15365 ODC1-204ENST00000446285 665 ntTSL 529.77■■■□□ 2.367e-8■■■■□ 22.6
PCBP1Q15365 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.837e-8■■■■□ 22.6
PCBP1Q15365 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.72e-8■■■■□ 22.5
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PCBP1Q15365 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 AC009779.3-201ENST00000551946 1024 ntTSL 213.49□□□□□ -0.252e-8■■■■□ 22.5
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PCBP1Q15365 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 BLOC1S1-206ENST00000553100 421 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.51e-6■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 SREBF2-208ENST00000491541 4043 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.754e-7■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 FSCN1-205ENST00000473330 2215 ntTSL 220.66■□□□□ 0.92e-10■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.362e-10■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 KIF2A-207ENST00000509663 759 ntTSL 321.73■■□□□ 1.079e-13■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.059e-13■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.739e-13■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.867e-7■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 HMGA2-208ENST00000537429 1527 ntTSL 1 (best)26.65■■□□□ 1.867e-7■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 HMGA2-207ENST00000537275 1508 ntTSL 1 (best)26.65■■□□□ 1.867e-7■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.477e-7■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.467e-7■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.397e-7■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.217e-7■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 CRLF1-205ENST00000597131 520 ntTSL 225.44■■□□□ 1.662e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 NCOR2-213ENST00000448614 582 ntTSL 317.09■□□□□ 0.332e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.475e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 FLOT1-212ENST00000487376 1583 ntTSL 520.46■□□□□ 0.875e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.959e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.58e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.461e-8■■■■□ 22.5
PCBP1Q15365 TMC6-224ENST00000593044 3070 ntTSL 216.89■□□□□ 0.298e-8■■■■□ 22.5
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