Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HERC3Q15034 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HERC3Q15034 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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