Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SMCO1Q147U7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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