Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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GBX1Q14549 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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GBX1Q14549 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GBX1Q14549 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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