Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DDX39BQ13838 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DDX39BQ13838 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms