Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SHROOM2Q13796 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
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SHROOM2Q13796 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
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SHROOM2Q13796 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SHROOM2Q13796 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SHROOM2Q13796 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
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