Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LAMC2Q13753 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LAMC2Q13753 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms