Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C1orf61Q13536 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C1orf61Q13536 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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