Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TOP3AQ13472 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TOP3AQ13472 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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