Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 INO4YOL108C 456 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 GCY1YOR120W 939 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YOR366WYOR366W 354 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RPS12YOR369C 432 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 POL3YDL102W 3294 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 TRS120YDR407C 3870 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 MDM36YPR083W 1740 nt3.5□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YMR018WYMR018W 1545 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 CWH41YGL027C 2502 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 BCH1YMR237W 2175 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 COM2YER130C 1332 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YMR046CYMR046C 1323 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RIX1YHR197W 2292 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 NUP60YAR002W 1620 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 NRG1YDR043C 696 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 BMH2YDR099W 822 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RUB1YDR139C 234 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 DIG2YDR480W 972 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 PUG1YER185W 912 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 SVP26YHR181W 687 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 PPX1YHR201C 1194 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YKL070WYKL070W 510 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YLR366WYLR366W 306 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 snR35snR35 204 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 SPT14YPL175W 1359 nt3.49□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 MAM1YER106W 909 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 USE1YGL098W 738 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YJL114WYJL114W 681 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RFA3YJL173C 369 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YBR116CYBR116C 528 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YHR080CYHR080C 4038 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YJL049WYJL049W 1353 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 VTC4YJL012C 2166 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 PIG2YIL045W 1617 nt3.48□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 EAP1YKL204W 1899 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 NTO1YPR031W 2247 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 ERP3YDL018C 678 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 SRB7YDR308C 423 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 GUK1YDR454C 564 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YAL064WYAL064W 285 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 SMD3YLR147C 306 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YLR339CYLR339C 552 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 PRM6YML047C 1059 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YNL203CYNL203C 612 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 YNL226WYNL226W 411 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 CUP9YPL177C 921 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 SYO1YDL063C 1863 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 RSE1YML049C 4086 nt3.47□□□□□ -1.85
RTP1Q12751 BMS1YPL217C 3552 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 SMC2YFR031C 3513 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 MUB1YMR100W 1863 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 PSF1YDR013W 627 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 ECO1YFR027W 846 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 GEP7YGL057C 864 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 MRPL9YGR220C 810 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 RPS21BYJL136C 264 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 RPS21AYKR057W 264 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YKR070WYKR070W 1059 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YLR365WYLR365W 333 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 PDR17YNL264C 1053 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YAK1YJL141C 2424 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 CHA4YLR098C 1947 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 TGL3YMR313C 1929 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 AEP1YMR064W 1557 nt3.46□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YBP2YGL060W 1926 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 REC8YPR007C 2043 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 TIF4631YGR162W 2859 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 DBP10YDL031W 2988 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 OST5YGL226C-A 261 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 VMA10YHR039C-A 345 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YHR212CYHR212C 336 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 SEC28YIL076W 891 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 LSM8YJR022W 330 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YAR060CYAR060C 336 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 GOT1YMR292W 417 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 TPK2YPL203W 1143 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YBR090CYBR090C 369 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 FLO1YAR050W 4614 nt3.45□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 SKO1YNL167C 1944 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 SSM4YIL030C 3960 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 MAK21YDR060W 3078 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 PFK26YIL107C 2484 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 LST7YGR057C 729 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 ERG25YGR060W 930 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 COX3Q0275 810 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YJL169WYJL169W 369 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 COX14YML129C 213 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 FAR3YMR052W 615 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 SRT1YMR101C 1032 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 RHO5YNL180C 996 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YDR061WYDR061W 1620 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 NOP56YLR197W 1515 nt3.44□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YPR022CYPR022C 3402 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YCR100CYCR100C 951 nt3.43□□□□□ -1.86
RTP1Q12751 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.43□□□□□ -1.86
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