Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACSM2AQ08AH3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM2AQ08AH3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms