Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSC1Q08554 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSC1Q08554 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms