Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR3Q06889 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms