Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SSBP1Q04837 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms