Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKOR1P84550 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms