Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IRX1P78414 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IRX1P78414 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IRX1P78414 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRX1P78414 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms