Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
H2BFSP57053 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2BFSP57053 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms