Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSCP56915 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSCP56915 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSCP56915 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSCP56915 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSCP56915 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSCP56915 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSCP56915 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSCP56915 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms