Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP1P54849 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP1P54849 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP1P54849 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP1P54849 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP1P54849 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP1P54849 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EMP1P54849 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EMP1P54849 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms