Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP1B3P54709 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1B3P54709 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms