Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 snR83snR83 306 nt3.42□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YDR149CYDR149C 708 nt3.42□□□□□ -1.86
HEF3P53978 IKI1YHR187W 930 nt3.42□□□□□ -1.86
HEF3P53978 EMC2YJR088C 879 nt3.42□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YOR238WYOR238W 912 nt3.42□□□□□ -1.86
HEF3P53978 KAP95YLR347C 2586 nt3.42□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YPP1YGR198W 2454 nt3.42□□□□□ -1.86
HEF3P53978 ENP2YGR145W 2124 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YGR067CYGR067C 2415 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 RPL13AYDL082W 600 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 RRP42YDL111C 798 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 COG7YGL005C 840 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YIR014WYIR014W 729 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 SNX4YJL036W 1272 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YJR111CYJR111C 852 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 SWD2YKL018W 990 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 CIN2YPL241C 807 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YBR287WYBR287W 1284 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YML096WYML096W 1578 nt3.41□□□□□ -1.86
HEF3P53978 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.4□□□□□ -1.86
HEF3P53978 FAS1YKL182W 6156 nt3.4□□□□□ -1.86
HEF3P53978 MGT1YDL200C 567 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YEA4YEL004W 1029 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 TAM41YGR046W 1158 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 CAF130YGR134W 3369 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 RGI2YIL057C 495 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 GPX1YKL026C 504 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YKT6YKL196C 603 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YKR033CYKR033C 426 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 BUR2YLR226W 1188 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YBL055CYBL055C 1257 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SET1YHR119W 3243 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 VPS64YDR200C 1815 nt3.4□□□□□ -1.87
HEF3P53978 TOP1YOL006C 2310 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SLY41YOR307C 1362 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SKN7YHR206W 1869 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 ETP1YHL010C 1758 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 GPM2YDL021W 936 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 QRI7YDL104C 1224 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 CGR1YGL029W 363 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YIP5YGL161C 933 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 MIG2YGL209W 1149 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 CTK2YJL006C 972 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 RNR2YJL026W 1200 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 LSM1YJL124C 519 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 MSN1YOL116W 1149 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 MCA1YOR197W 1299 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SPR2YOR214C 711 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YPR077CYPR077C 372 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 MIP6YHR015W 1980 nt3.39□□□□□ -1.87
HEF3P53978 PFK26YIL107C 2484 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 EBS1YDR206W 2655 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SQS1YNL224C 2304 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 CHS3YBR023C 3498 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 AXL1YPR122W 3627 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YDL162CYDL162C 357 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 ECM11YDR446W 909 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 DLS1YJL065C 504 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 NDL1YLR254C 570 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 TVP18YMR071C 504 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 RCE1YMR274C 948 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 APM3YBR288C 1452 nt3.38□□□□□ -1.87
HEF3P53978 ATC1YDR184C 885 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 GTR2YGR163W 1026 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YHR097CYHR097C 1101 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YJR020WYJR020W 333 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YPT6YLR262C 648 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SUB1YMR039C 879 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 ATG3YNR007C 933 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 RPS7AYOR096W 573 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 FAR1YJL157C 2493 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 SLP1YOR154W 1764 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 HBT1YDL223C 3141 nt3.37□□□□□ -1.87
HEF3P53978 RIM1YCR028C-A 408 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 TVP15YDR100W 432 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 PRE1YER012W 597 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 COQ9YLR201C 783 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 BET5YML077W 480 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 MGE1YOR232W 687 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 RFC5YBR087W 1065 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 AEP2YMR282C 1743 nt3.36□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YAK1YJL141C 2424 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 FRE4YNR060W 2160 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 TGL2YDR058C 981 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YJL032WYJL032W 315 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 NNF1YJR112W 606 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 NBP1YLR457C 960 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YPL276WYPL276W 438 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 DNA2YHR164C 4569 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 PHO81YGR233C 3537 nt3.35□□□□□ -1.87
HEF3P53978 PIN4YBL051C 2007 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 YHR078WYHR078W 1659 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 ALG8YOR067C 1734 nt3.34□□□□□ -1.87
HEF3P53978 FRQ1YDR373W 573 nt3.34□□□□□ -1.87
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