Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NKX2-5P52952 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms