Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMTP48728 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMTP48728 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMTP48728 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMTP48728 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMTP48728 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMTP48728 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMTP48728 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMTP48728 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMTP48728 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMTP48728 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMTP48728 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AMTP48728 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AMTP48728 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms