Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CAPZBP47756 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPZBP47756 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms