Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSFP46459 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSFP46459 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSFP46459 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSFP46459 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSFP46459 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NSFP46459 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSFP46459 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSFP46459 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSFP46459 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSFP46459 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSFP46459 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSFP46459 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSFP46459 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSFP46459 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSFP46459 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms