Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSMC4P43686 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMC4P43686 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms