Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFI27P40305 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFI27P40305 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms