Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT9P35527 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT9P35527 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT9P35527 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT9P35527 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT9P35527 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT9P35527 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms