Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 NDUFS7-212ENST00000540530 1707 ntTSL 222.43■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-213ENST00000543289 3356 ntTSL 220.68■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-220ENST00000622587 802 ntTSL 520.56■□□□□ 0.884e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-215ENST00000546172 869 ntTSL 519.98■□□□□ 0.794e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-207ENST00000538523 931 ntTSL 219.18■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-204ENST00000436115 2879 ntTSL 518.11■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-205ENST00000534853 745 ntTSL 517.18■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-214ENST00000545446 3089 ntTSL 217.13■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-208ENST00000538662 1186 ntTSL 216.77■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-209ENST00000538929 630 ntTSL 416.35■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.711e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.471e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.281e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CCM2-211ENST00000478582 937 ntTSL 329.05■■■□□ 2.241e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TMEM259-210ENST00000592618 1877 ntTSL 527.34■■□□□ 1.976e-13■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TMEM259-208ENST00000592052 1637 nt26.39■■□□□ 1.816e-13■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.761e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.754e-11■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.644e-11■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 ZNF664-208ENST00000540009 753 ntTSL 324.93■■□□□ 1.581e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.8■■□□□ 1.561e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 ZNF664-210ENST00000541448 567 ntTSL 324.34■■□□□ 1.491e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 ZNF664-212ENST00000542820 802 ntTSL 1 (best)24.17■■□□□ 1.461e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.244e-11■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CCM2-203ENST00000461377 1983 ntTSL 522.76■■□□□ 1.231e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 ZNF664-211ENST00000542493 591 ntTSL 422.51■■□□□ 1.191e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 ZNF664-214ENST00000546098 474 ntTSL 421.6■■□□□ 1.051e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 CCM2-216ENST00000488727 1719 ntTSL 521.3■■□□□ 11e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 521.07■□□□□ 0.964e-11■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.891e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TMEM259-211ENST00000593068 1965 ntTSL 520.49■□□□□ 0.876e-13■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 WNK2-208ENST00000453718 1937 ntTSL 519.58■□□□□ 0.723e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 WNK2-214ENST00000474009 561 ntTSL 319.23■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.611e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 SP5-202ENST00000487037 257 ntTSL 317.73■□□□□ 0.431e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 PPP6R1-206ENST00000591323 848 ntTSL 317.65■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 ZNF664-205ENST00000539257 271 ntTSL 516.53■□□□□ 0.241e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 ZNF664-213ENST00000543017 455 ntTSL 516.25■□□□□ 0.191e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 WNK2-207ENST00000448251 3224 ntTSL 215.4■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 ZNF664-203ENST00000537532 592 ntTSL 413.98□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 TMEM259-204ENST00000586285 626 ntTSL 312.94□□□□□ -0.346e-13■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 WNK2-216ENST00000479696 532 ntTSL 39.09□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 31.2
GTF2F1P35269 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.695e-8■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.738e-7■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 ST20-MTHFS-202ENST00000494999 632 ntTSL 325.04■■□□□ 1.68e-7■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.078e-7■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.988e-7■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.612e-9■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)20.85■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 314.52□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 CPNE7-205ENST00000529800 519 ntTSL 511.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 FNDC3B-209ENST00000478016 554 ntTSL 44.21□□□□□ -1.745e-7■■■■■ 31.1
GTF2F1P35269 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.051e-11■■■■■ 31
GTF2F1P35269 SETD5-208ENST00000421188 1323 ntTSL 510.31□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.91e-11■■■■■ 31
GTF2F1P35269 SETD5-206ENST00000413704 3428 ntTSL 28.54□□□□□ -1.041e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 SETD5-228ENST00000493918 4861 ntTSL 1 (best)8.15□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 SETD5-217ENST00000466242 4038 ntTSL 27.51□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 COQ8A-207ENST00000485462 2141 ntTSL 1 (best)18.69■□□□□ 0.583e-7■■■■■ 31
GTF2F1P35269 ZFPM1-202ENST00000562417 497 ntTSL 318.83■□□□□ 0.69e-7■■■■■ 31
GTF2F1P35269 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.244e-10■■■■■ 31
GTF2F1P35269 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 TYK2-218ENST00000531836 644 ntTSL 420.88■□□□□ 0.935e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 TYK2-216ENST00000530829 720 ntTSL 520.76■□□□□ 0.915e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.265e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 CUL1-203ENST00000602748 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 31
GTF2F1P35269 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 31
GTF2F1P35269 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 31
GTF2F1P35269 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31
GTF2F1P35269 CERS2-202ENST00000345896 2170 ntTSL 234.51■■■■□ 3.122e-9■■■■■ 31
GTF2F1P35269 CERS2-203ENST00000361419 997 ntTSL 233.87■■■■□ 3.012e-9■■■■■ 31
GTF2F1P35269 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.692e-9■■■■■ 31
GTF2F1P35269 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.322e-9■■■■■ 31
GTF2F1P35269 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 31
GTF2F1P35269 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 31
GTF2F1P35269 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 31
GTF2F1P35269 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 31
GTF2F1P35269 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 31
GTF2F1P35269 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.048e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 AL390719.1-203ENST00000456409 750 ntTSL 212.96□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 KPNA4-202ENST00000469804 790 ntTSL 227.59■■■□□ 2.018e-10■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 INPPL1-211ENST00000541544 530 ntTSL 226.38■■□□□ 1.811e-11■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.593e-11■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 ZNF444-210ENST00000592171 688 ntTSL 324.95■■□□□ 1.581e-8■■■■■ 30.9
GTF2F1P35269 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.078e-10■■■■■ 30.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 114.7 ms