Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM4P33991 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM4P33991 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM4P33991 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM4P33991 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MCM4P33991 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MCM4P33991 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MCM4P33991 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MCM4P33991 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM4P33991 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM4P33991 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM4P33991 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM4P33991 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MCM4P33991 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MCM4P33991 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MCM4P33991 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MCM4P33991 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms