Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD1P33897 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCD1P33897 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms