Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMPK1P30085 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms