Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALDH4A1P30038 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms