Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNE1P24864 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms