Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCB4P21439 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB4P21439 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms