Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A1P19634 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A1P19634 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms