Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME1P15531 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NME1P15531 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME1P15531 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NME1P15531 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NME1P15531 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NME1P15531 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NME1P15531 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NME1P15531 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NME1P15531 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms