Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VPREB1P12018 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VPREB1P12018 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms