Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TNP1P09430 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TNP1P09430 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
TNP1P09430 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -1
TNP1P09430 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
TNP1P09430 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms