Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TFAP2AP05549 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TFAP2AP05549 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAP2AP05549 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAP2AP05549 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TFAP2AP05549 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms