Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP1P01033 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP1P01033 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms